Alergeni so snovi, ki sprožijo alergijsko reakcijo. Ponavadi so to povsem neškodljive snovi, ki pa pri nekaterih sprožijo buren/pretiran imunski odziv. Pogosti alergeni so: cvetni prah, jajčni beljak, hrana, pršice. Razdelimo jih lahko v različne skupine: alergeni mikroorganizmov (antigeni bakterij, virusov, gliv), alimentarni alergeni (sadje, zelenjava, mleko…), razna zdravila (antibiotiki, cepiva…), inhalacijski alergeni (pršice, plesni, zeli…) in še nekateri drugi.